Бактерия, которая ест вашу слизь, — и почему это нормально
Akkermansia muciniphila — обычный житель кишечника. Она живёт в слое слизи и питается муцином, белком, который кишечник вырабатывает сам. Слизь от этого обновляется активнее: у мышей и в одном небольшом исследовании на людях это совпало с более плотным барьером и лучшими показателями обмена. Уберите клетчатку или добавьте возбудителя инфекции — тот же аппетит слой истончает. Итог зависит от питания.
- Вид
- Akkermansia muciniphila
- Syn.
- Verrucomicrobia
- NCBI
- txid239935
- Wikidata
- Q15020908
Давайте начнём не с заголовка, а с самой бактерии. В 2004 году микробиологи Вагенингенского университета обошлись с образцом человеческого кала нарочно жестоко: развели его так, что выжить почти никто не мог, а тем, кто выжил, предложили одну-единственную еду — желудочный муцин, тот самый белок, из-за которого слизь скользкая 1. Ни сахара, ни крахмала, ни клетчатки. Ешь слизь или голодай.
Слизь кто-то съел. Это оказалась овальная клетка — она не двигается, не образует спор, не переносит кислорода и по Граму не окрашивается; росла она поодиночке и парами. Ближайший из уже описанных родственников совпадал с ней по гену рибосомной РНК только на 92 %, а это далеко: под неё пришлось заводить отдельный род 1. Назвали её Akkermansia muciniphila — «любящая слизь». Это не красивый образ. Это должностная инструкция.
Если совсем коротко
Akkermansia muciniphila — бактерия, которая живёт без кислорода, расщепляет муцин (белок слизи), поселяется прямо в слизистом слое человеческого кишечника и питается тем муцином, который хозяин там же и выделяет 1. Относится к типу Verrucomicrobiota. Типовой штамм называется MucT, в коллекции он лежит как ATCC BAA-835 1.
Где именно она живёт
Не в середине кишечного содержимого, где обычно считают всех знаменитых кишечных бактерий, а в слое прямо над клетками — в слизистом «одеяле», которое стенка кишечника непрерывно обновляет. Этот адрес объясняет про неё всё остальное.
Когда та же группа собрала генетический зонд и посчитала вид в кале, вышло больше 1 % всех бактериальных клеток 2. Для одного вида в сообществе из сотен видов это очень много.
И сразу оговорка, вслух: кал — это не квартира, а то, что из квартиры вынесли. Дом бактерии — слизь, а счёт по калу лишь приблизительно на этот дом намекает.
Что она делает для нас
Здесь начинается самое интересное — и здесь мне нужны не восторги, а названные работы.
Она идёт рядом с более здоровым обменом веществ. В 2013 году группа из Лувенского и Вагенингенского университетов показала на мышах: при ожирении и диабете второго типа этой бактерии становится меньше, пребиотическое питание её возвращает, а если дать живую бактерию мышам на жирном корме, у них не набирается лишняя жировая масса, не развивается воспаление жировой ткани и не падает чувствительность к инсулину 3. И вот деталь, которую в пересказах обычно теряют: убитые нагреванием клетки не дали ничего 3. Так и выглядит честный механизм — тот, который может и не сработать.
За этим стоит конкретная молекула. В 2017 году из оболочки бактерии выделили белок Amuc_1100. Он подаёт сигнал клеткам кишечника через два иммунных рецептора, поднимает противовоспалительный интерлейкин-10 и повышает трансэпителиальное сопротивление — так в лаборатории измеряют, насколько плотно сомкнут слой клеток 4. Сначала механизм, потом выводы: бактерия сидит в слизи, разговаривает с иммунными рецепторами клеток под собой, и барьер в ответ становится плотнее.
Людям её давали один раз и очень осторожно. В 2019 году журнал Nature Medicine напечатал пробное исследование — проверку самой идеи. Набрали 40 добровольцев с лишним весом и сниженной чувствительностью к инсулину, 32 из них прошли три месяца ежедневного приёма: живая бактерия, пастеризованная или пустышка 5. Переносилось хорошо, ничего опасного не случилось. У пастеризованной формы чувствительность к инсулину выросла на 28,62 % (P = 0,002), уровень инсулина в крови снизился на 34,08 %, общий холестерин — на 8,68 % 5.
А теперь оговорка в полный голос. Вес снизился на 2,27 кг, жировая масса — на 1,37 кг, и ни одна из этих двух цифр не достигла статистической значимости, то есть могла получиться случайно (P = 0,091 и P = 0,092) 5. Это одноцентровое поисковое исследование на 32 людях, и главным, что в нём проверяли, были безопасность, переносимость и показатели обмена 5. Это повод провести большое исследование. Это не повод строить на нём диету.
Она попадается рядом с ответом на иммунотерапию рака. В работе 2018 года в журнале Science у пациентов, которых лечили одним из видов иммунотерапии, доля A. muciniphila в кале на момент диагноза шла вместе с ответом на лечение; а мышам, которым пересадили кал не ответивших пациентов, приём бактерии внутрь ответ возвращал 9. У людей — совпадение. У мышей — причина. Обе половины этой фразы одинаково важны.
Что она делает против нас
То же самое действие, прочитанное с другой стороны. Бактерия, которая ест слизь, истончает ту самую перегородку между иммунной системой и содержимым кишки. Чем это кончится, зависит от соседей.
Если рядом возбудитель, становится хуже. Мышам, выращенным стерильными и заселённым известным набором из восьми видов бактерий, к заражению Salmonella Typhimurium добавили A. muciniphila. Повреждение ткани под микроскопом стало сильнее, а сигналы воспаления в слепой и толстой кишке — IFN-γ, TNF-α, IL-6, IL-12, IL-17 — поднялись 6. Сальмонелл в ближайших лимфоузлах стало примерно в десять раз больше, а клеток, которые запасают слизь, в ткани слепой кишки осталось от трети до половины от того, что было в других группах 6. Вывод самих авторов: она сбивает у хозяина равновесие слизи 6.
Без клетчатки за подкладку берётся всё сообщество. В работе 2016 года в журнале Cell стерильным мышам поселили собранную человеческую микробиоту, а потом убрали из корма клетчатку. Оставшись без растительных углеводов, сообщество — а любители слизи, включая Akkermansia, были в нём на видном месте — перешло на слизь хозяина, источило слизистый барьер толстой кишки и пропустило возбудителя Citrobacter rodentium прямо к стенке, до смертельного воспаления 7. Вот практический урок всей этой статьи: пожиратель слизи ест слизь в основном тогда, когда ничего лучше ему не предложили.
Её количество — не оценка здоровья. Объединённый анализ работ по микробиоте кишечника при болезни Паркинсона нашёл у пациентов Akkermansia повышенной, а бактерий, вырабатывающих масляную кислоту, — пониженными 8. Именно повышенной, не пониженной. Одним из объяснений авторы называют разрушение слоя слизи 8, но это связь, найденная в одномоментных данных, и медленный кишечник, запоры и лекарства остаются такими же живыми объяснениями. Куда смотрит стрелка причины, никто пока не показал.
Один организм, два написания
Название вида не менялось с 2004 года 1. Менялось название типа вокруг него. То, что во всех старых работах зовётся Verrucomicrobia, в 2021 году было действительно опубликовано по кодексу номенклатуры бактерий как Verrucomicrobiota — тогда сразу 42 названия типов оформили официально 10. Организмы те же, написание нынешнее. Так что если в работе 2013 года вы видите Verrucomicrobia, а в работе 2023-го — Verrucomicrobiota, никого не переклассифицировали. Просто правила догнали.
Что забрать домой
Akkermansia muciniphila — обычный житель здорового кишечника, который кормится слизью, произведённой вами же. Похоже, что подстриженный слой от этого обновляется активнее, а барьер становится плотнее: у мышей и в одном небольшом исследовании на людях это выглядело как более хорошие показатели обмена 35. Уберите из еды клетчатку или добавьте возбудителя — и тот же самый аппетит превращается в разрушение 67. Всё, что есть по людям, — это 32 человека в поисковом исследовании и набор совпадений, а совпадение — это ещё не причина 59.
Это правда обнадёживает. И это правда пока не решено. Сказать обе вещи разом — единственный честный способ написать такую статью. Пугаться нечего: бактерия эта есть почти у всех и живёт там всю вашу жизнь. Бежать за добавкой тоже пока не за чем. А клетчатка в тарелке — то немногое в этой истории, что уже проверено экспериментом 7.
Главные факты
- Описана и названа в 2004 году: её вырастили из человеческого кала на муцине как единственном источнике углерода и азота; типовой штамм — MucT.1
- По подсчёту флуоресцентной гибридизацией in situ на неё приходится больше 1 % всех бактериальных клеток человеческого кала.2
- У мышей живая A. muciniphila отменяла набор жировой массы и инсулинорезистентность на жирном корме; убитые нагреванием клетки — нет.3
- В поисковом исследовании на 32 людях три месяца пастеризованной A. muciniphila улучшили чувствительность к инсулину на 28,62 % против плацебо (P = 0,002).5
- У стерильно выращенных мышей, заражённых Salmonella Typhimurium, A. muciniphila усилила воспаление кишечника и подняла число сальмонелл в брыжеечных лимфоузлах примерно в десять раз.6
- Тип, к которому она относится, действительно опубликован под названием Verrucomicrobiota в 2021 году; в старых работах он называется Verrucomicrobia.10
Частые вопросы
Так она полезная или вредная?
И то и другое — смотря в каких условиях. Одно и то же действие, подстригание муцина, у мышей и в одном небольшом исследовании на людях шло вместе с более толстым слоем слизи и лучшими показателями обмена [s3][s5], а при возбудителе рядом или при еде без клетчатки — с более тяжёлым воспалением и инфекцией [s6][s7]. Это житель, а не герой и не злодей.
Если она ест слизь, значит, она портит мне кишечник?
Сама по себе — нет. Слизь выделяется и обновляется постоянно, а сахара, которые освобождаются при её расщеплении, идут в пищу другим бактериям. Разрушение слоя появлялось там, где в еде не было клетчатки и сообществу больше нечего было есть [s7], или там, где в кишечнике одновременно сидел возбудитель [s6].
Можно ли принимать её как добавку?
Одно рандомизированное плацебо-контролируемое пробное исследование на 32 людях показало, что три месяца ежедневного приёма переносятся хорошо и безопасны, а у группы с пастеризованной бактерией улучшилась чувствительность к инсулину [s5]. Это проверка самой идеи, где главной задачей была безопасность, — не разрешение и не лечение. Ответ дали бы большие исследования.
Почему в одних работах Verrucomicrobia, а в других Verrucomicrobiota?
Организмы те же, название новее. Ранг типа вошёл в кодекс номенклатуры бактерий, и в 2021 году сразу 42 названия типов были действительно опубликованы, Verrucomicrobiota среди них [s10]. Всё, что написано раньше, использует старое написание.
Много Akkermansia в анализе — значит, я здоров?
Ни один род не читается как оценка здоровья. Объединённый анализ работ по болезни Паркинсона нашёл Akkermansia у пациентов повышенной, а не пониженной [s8] — это связь, и куда смотрит стрелка причины, неизвестно. Цифра в анализе кала — описание, а не диагноз.
Источники
- Derrien M. et al., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2004 — doi:10.1099/ijs.0.02873-0
- Derrien M. et al., Applied and Environmental Microbiology, 2008 — doi:10.1128/AEM.01226-07
- Everard A. et al., PNAS, 2013 — doi:10.1073/pnas.1219451110
- Ottman N. et al., PLoS ONE, 2017 — doi:10.1371/journal.pone.0173004
- Depommier C. et al., Nature Medicine, 2019 — doi:10.1038/s41591-019-0495-2
- Ganesh B. P. et al., PLoS ONE, 2013 — doi:10.1371/journal.pone.0074963
- Desai M. S. et al., Cell, 2016 — doi:10.1016/j.cell.2016.10.043
- Kleine Bardenhorst S. et al., European Journal of Neurology, 2023 — doi:10.1111/ene.15671
- Routy B. et al., Science, 2018 — doi:10.1126/science.aan3706
- Oren A., Garrity G. M., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2021 — doi:10.1099/ijsem.0.005056